Enligt Vita husets informatör Sean Spicer följde presidenten justitieminister Jeff Sessions och biträdande justitieministern Rod Rosensteins rekommendationer i frågan.
Spicer tillade att letandet efter en ny FBI-chef inleds omedelbart.
Trump meddelade i ett brev till Comey att han är avskedad med omedelbar verkan. Trump skriver i brevet bland annat att det är viktigt att FBI får en chef som återställer allmänhetens förtroende för en betydande övervakare av lagen.
Enligt amerikanska medier har Trumps regering låtit förstå att orsaken till avskedandet är Comeys agerande i utredningen av Demokraternas Hillary Clintons e-post.
Det är en förklaring som Demokraterna inte sväljer. De anser att Comey avskedades för att FBI:s utredningar av Rysslands agerande under valkampanjen kom för nära Vita huset. Senatens demokratiske ledare Chuck Schumer säger att han har sagt till Trump att avskedandet är ett stort misstag.
Utrikes
10.5.2017
Trump sparkade FBI-chefen
USA:s president Donald Trump har avskedat den federala polisen FBI:s chef James Comey.