Uppskjutningen skedde i närheten av kuststaden Wonsan.
Sydkoreas president Moon Jae-In har kallat till möte med det nationella säkerhetsrådet med anledning av händelsen.
Uppskjutningen följer uppgifter om att Nordkorea genomfört tester med ett nytt luftvärnsvapen, som publicerats av landets statliga nyhetsbyrå. Testet har övervakats av Kim Jong-Un själv, heter det. Luftvärnsvapnet är enligt diktatorn nu redo för massproduktion, skriver nyhetsbyrån AFP.
Vapentesterna spär på den ökade spänningen i regionen efter en serie robottester genomförda av Pyongyang.
Luftvärnsvapnet ska "upptäcka och slå mot olika mål i luften från alla håll". Det första testet ska ha genomförts i april i fjol, och vapnet uppges efter det ha förfinats.
Utrikes
29.5.2017
Nordkorea avfyrade ny robot
Nordkorea har avfyrat vad som bedöms vara en ballistisk robot, uppger den sydkoreanska militären enligt nyhetsbyrån Yonhap.