O'Brien som nyligen besökte landet sade att antalet interna flyktingar ökat och att våldet mot dem som försöker hjälpa till ökat.
Centralafrikanska republiken med en befolkning på 4,5 miljoner har cirka 600 000 internflyktingar vilket är en ökning med omkring 40 procent från fjolåret.
O'Brien har redan tidigare uppmanat FN att skicka mer trupper till landet för att stöda den fredsbevarande operationen. I nuläget har FN cirka 12 500 poliser eller soldater i landet som hjälper till med att skydda civilbefolkningen och president Faustin-Archange Touaderas styre.
Centralafrikanska republiken är ett av världens fattigaste länder och konflikten har pågått sedan 2013. Konflikten bröt ut i samband med att den kristne presidenten François Bozize drevs bort av den muslimska rebellgruppen Seleka under 2013. Kuppen utlöste en serie hämndattacker mellan kristna och muslimska grupper.
Utrikes
23.8.2017
Biståndschef: Tecken på folkmord i Centralafrikanska republiken
Det finns vissa tidiga tecken på folkmord i Centralafrikanska republiken. Det här har FN:s biståndschef Stephen O'Brien sagt bakom stängda dörrar, uppger diplomatkällor.